Los criterios de enlace especifican la disimilitud de conjuntos como una función de las distancias dos a dos entre observaciones de los conjuntos, las más utilizadas se detallan a continuación:

Agrupamiento de máximo o enlace completo

Calcula todas las diferencias de pares entre los elementos del clúster 1 y los elementos del clúster 2, y se queda con el valor mayor como distancia entre el cluster 1 y 2. Busca grupos compactos.

Agrupamiento de mínimo o enlace simple

Calcula todas las diferencias de pares entre los elementos del clúster 1 y los elementos del clúster 2, y se queda con el valor menor como distancia entre el cluster 1 y 2. Busca racimos largos y «sueltos».

Agrupamiento del enlace promedio

Calcula todas las diferencias de pares entre los elementos del clúster 1 y los elementos del clúster 2, y se queda con el valor promedio como distancia entre el cluster 1 y 2.

Agrupamiento de mínima energía

Criterio de Ward

V-enlace